⑴ 采用手動高真空蝶閥（部分國產機），蝶閥的開啟關閉全靠人工操作，反應速度很慢。冷凍干燥過程如突然發生停電停水，操作人員萬一遲緩一步關閉高真空蝶閥，制品就會污染報廢。
⑵ 采用氣動型、電動型自動高真空蝶閥（全部進口機和大部分為國產機），蝶閥的開啟關閉靠電氣推動，反應速度較快，當冷凍干燥過程突然發生停電停水時，它會在1左右時間內自動關閉；當恢復供電時，閥門開啟時間也在1左右，由于開啟過快往往造成干制品飛散，耗損嚴重。