養殖污水處理工藝根據污水的排放特點、水質特點及場區出水要求，確定工藝分三個部分：
 

　　一是預處理，去除水中的懸浮物和浮油，降低后續處理的負荷并防止后續處理(尤其是生化處理)單元堵塞而影響處理效果，主要采用物理處理方法和化學處理方法；
 

　　二是生化處理，這是整個處理工藝的核心，通過微生物的新陳代謝，分解污水中溶解性機物；
 

　　三是深度處理，采用物理處理方法和化學處理方法，進一步去除水中的污染物，以排放。
 

　　1.預處理畜禽養殖污水論以何種工藝或綜合措施進行處理，都要采取一定的預處理措施。通過預處理可使污水污染物負荷降低，同時防止大的固體或雜物進入后續處理環節，造成設備的堵塞或破壞等。針對污水中的大顆粒物質或易沉降的物質，畜禽養殖業采用過濾、離心、沉淀等固液分離技術進行預處理，其中常用的篩濾法和沉淀法。篩濾法常見的工藝格柵和固液分離，格柵用于養殖污水場集污池前端，主要是去除污水中的樹枝、枯草、塑料袋、輸精管、針管等大型漂浮物質，以免影響后端的固液分離；固液分離是養殖污水處理*的主要工藝，甚至成為核心工藝，主要是去除污水中的糞便，減小后端污水處理難度，減小生化運行負荷，常見的固液分離機振動篩固液分離機和滾筒式固液分離機兩種，根據不同的養殖工藝使用不同的固液分離機，達到分離效果。沉淀法常用的工藝沉砂池和沉淀池兩種。
 

　　2.生化處理(二處理)根據養殖污水高生化性的特點，生化處理技術越來越多的出現在了養殖污水處理中，生化處理根據其工作原理的不同可以分為：厭氧生化處理、好氧生化處理和自然處理法。
 

　　①厭氧生化處理：厭氧生物處理技術即為在厭氧狀態下，污水中的機物被厭氧細菌分解、代謝、消化，使得污水中的機物含量大幅減少，同時產生沼氣的一種的污水處理方式。在厭氧處理過程中，污水中的機物經大量微生物的共同，被終轉化為甲烷、二氧化碳、水、硫化氫和氨等。常用的方法：完混合式厭氧消化器(CSTR)、厭氧接觸反應器、厭氧濾池(AF)、上流式厭氧污泥床(UASB)、厭氧流化床(AFB)、升流式固體反應器(USR)等。目前養殖場污水處理主要采用的是上流式厭氧污泥床及升流式固體反應器工藝。

　　②好氧生化處理：好氧處理的基本原理是利用微生物在好氧條件下分解機物，同時合成自身細胞(活性污泥)。在好氧處理中，可生物降解的機物終可被完氧化為簡單的機物。該方法主要活性污泥法和生物濾池、生物轉盤、生物接觸氧化、序批式活性污泥法、A/O及氧化溝等。
 

　　③自然處理技術：自然處理法是利用天然水體、土壤和生物的物理、化學與生物的綜合來凈化污水。其凈化方式主要包括過濾、截留、沉淀、物理和化學吸附、化學分解、生物氧化以及生物的吸收等。其原理涉及生態系統中物種共生、物質循環再生原理、結構與功能協調原則，分層多截留、儲藏、利用和轉化營養物質機制等。這類方法投資省、工藝簡單、動力消耗少，但凈化功能受自然條件的制約。自然處理的主要模式氧化塘、土壤處理法、人工濕地處理法等。
 

　　3.深度處理(三處理)深度處理為進一步處理生化處理未能去除的污染物的凈化過程。深度處理通常由以下處理單元優化組合而成：混凝沉淀、膜技術等。
 

　　①混凝沉淀法：混凝沉淀法就是向污水中投加混凝藥劑，使其中的膠體和細微懸浮物脫穩，并聚集為數百微米以至數毫米的礬花，進而可以通過重力沉降或其他固液分離手段予以去除的污水處理技術。
 

　　②膜分離技術：膜分離法是利用特殊的薄膜對液體中的成分進行選擇性分離的技術。用于污水處理的膜分離技術包括擴散滲析、電滲析、反滲透、濾、微濾等幾種。
 

　　③膜生物反應器(MBR)膜生物反應器工藝(MBR工藝)是膜分離技術與生物技術機結合的污水處理技術，也稱膜分離活性污泥法。它利用膜分離設備將生化反應池中的活性污泥和大分子機物質截留住，水力停留時間(HRT)和污泥停留時間(SRT)可以分別控制，而難降解的物質在反應器中不斷反應、降解。一方面，膜截留了反應池中的微生物，使反應池中的活性污泥濃度大大增加，使降解污水的生化反應進行得更迅速更，另一方面，由于膜的高過濾精度，了出水清澈透明從而省掉二沉池。因此，膜生物反應器工藝通過膜分離技術大大強化了生物反應器的功能。與傳統的生物處理方法相比，具生化、抗負荷沖擊能力強、排泥周期長、易實現自動控制等優點，是目前前途的污水處理新技術。