(1)溫濕度控制
夏季：調節表冷盤管動態壓差平衡調節閥的開度以控制室內溫濕度，濕度優先;當為了調節室內濕度而造成溫度過低時，開啟加熱盤管以控制室內溫度。
冬季：調節加熱盤管動態壓差平衡電動調節閥的開度以控制室內溫度，調節加濕器的開度以控制濕度。
(2)壓力及變頻控制
在空調系統各房間送風支管上設置壓力無關型定風量閥，無工藝設備排風房間的排風支管上設置壓力無關型定風量閥，從而恒定房間的風量以控制房間壓力;在有工藝設備排風房間的排風支管上設變風量閥，根據房間內壓差動作，以控制房間壓力。需排風的工藝設備(如生物柜)排風支管上設變風量閥，根據設備開啟度調節設備排風量。
根據重要房間送風管上定風量閥前后壓差調節送風機變頻器，保持壓差恒定值。此恒定值須由現場實調確認，以保證所有定風量閥正常工作為準。
由以上原理圖可知，PCR實驗室壓差控制難點在于有生物柜房間的壓差控制以及維持生物柜負壓環境以保證設備正常運行使用，這就要求系統采用的變風量閥有快速的反應能力。根據相關實驗證明，當生物柜變風量閥響應時間≤1s且房間排風支管變風量閥響應時間≤3s時，不會對生物柜內的負壓環境產生影響。同時，為了防止實驗室房間開關門的瞬間失壓導致房間壓差為零，房間各定、變風量閥應預設風量偏移限制，以避免房間失壓時引起送風量過小的情況發生。
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