來自河南省疾病預(yù)防控制中心，武漢華大基因研究院，軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院的研究人員發(fā)表了題為“Metagenomic Analysis of Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome （FTLS） in Henan Province, China: Discovery of a New Bunyavirus”的文章，發(fā)現(xiàn)了自07年就出現(xiàn)在我國的蜱蟲病的致病病毒：新布尼亞病毒，這一研究組也研發(fā)出了相關(guān)的診斷試劑，并應(yīng)用于該病的監(jiān)測診斷中，目前還啟動疫苗研發(fā)。相關(guān)成果公布在PLoS Pathogens雜志上。文章的通訊作者是河南省疾病預(yù)防控制中心的許汴利教授，以及武漢華大基因研究院的陳唯軍教授，前者早年畢業(yè)于河南醫(yī)科大學(xué)，主要研究方向是分子生物學(xué)、傳染病及寄生蟲病流行病學(xué)。
據(jù)報道，中國疾病預(yù)防控制中心數(shù)據(jù)顯示截至今年6月份，中國已有河南省、湖北省、山東省、安徽省、江蘇等省報告“蜱蟲病”病例280多人，死亡10余人。這種疾病學(xué)名發(fā)熱伴血小板減少綜合征，是一種自然疫原性疾病，蜱為其傳播媒介。該病以發(fā)熱伴血小板減少為主要表現(xiàn)，大多數(shù)患者有惡心、嘔吐及食欲不振等消化道癥狀和乏力等表現(xiàn)，其中少數(shù)重癥患者可因多臟器損害，救治無效死亡。 在2007年起，這一研究組就在河南省信陽、南陽地區(qū)發(fā)現(xiàn)了這一新發(fā)傳染病，2010年從病例血樣標(biāo)本中成功分離出了一種新的病毒，命名為新布尼亞病毒，繼而從分子生物學(xué)、免疫學(xué)、流行病學(xué)和臨床特點(diǎn)等方面證明了這一新布尼亞病毒與該新發(fā)傳染病之間的致病關(guān)系，從而確定了新布尼亞病毒為“蜱蟲病”的主要元兇。這對于“蜱蟲病”的檢測診斷、臨床救治和預(yù)防控制以及開展深入研究有重要意義。
值得關(guān)注的是，這項(xiàng)研究采用了一種有別于上傳統(tǒng)發(fā)現(xiàn)新病毒的新型技術(shù)路線：采用宏基因測序技術(shù)首先發(fā)現(xiàn)未知病毒基因片段，建立分子生物學(xué)檢測方法，再篩查出陽性標(biāo)本，指導(dǎo)病毒分離。宏基因組測序是對特定環(huán)境（或者特定生境）樣品中的微生物群體基因組，進(jìn)行序列的測定，以分析微生物群體基因組成及功能，解讀微生物群體的多樣性與豐度，探求微生物與環(huán)境，微生物與宿主之間的關(guān)系，發(fā)掘和研究新的、具有特定功能的基因。
這種測序方法避開了微生物分離培養(yǎng)的過程，擴(kuò)展了微生物資源的利用空間，為研究微生物相互作用提供了有效工具，可以用于篩選疾病關(guān)聯(lián)的微生物，鑒定疾病關(guān)聯(lián)的微生物基因及其功能，疾病預(yù)防及診斷，和微生態(tài)制劑開發(fā)。這篇文章采用的是Illumina高通量測序技術(shù)，以及華大基因的軟件包：SOAP（Short Oligonucleotide Analysis Package），這個主要是為生物信息工作者提供實(shí)用的新一代測序技術(shù)的基礎(chǔ)生物信息工具。