WinRHIZO根系分析系統(tǒng)主要用于分析根系長度、直徑、面積、體積、根尖記數(shù)等，功能強大，操作簡單，廣泛運用于根系形態(tài)和構(gòu)造研究。是一套用于洗根后的專業(yè)根系分析系統(tǒng)。

    WinRHIZO根系分析系統(tǒng)的原理是利用高質(zhì)量圖形掃描系統(tǒng)提供高分辨率的彩色圖像或黑白圖像，該掃描系統(tǒng)匹配專門的雙光源照明系統(tǒng)，去除了陰影和不均勻現(xiàn)象的影響，有效的保證了圖像的質(zhì)量。采用非統(tǒng)計學(xué)方法測量計算出交叉重疊部分根系長度等參量，WinRHIZO根系分析系統(tǒng)可以讀取TIFF，JPEG標準格式的圖像。

    WinRHIZO根系分析系統(tǒng)由圖像撲捉系統(tǒng)和根系分析系統(tǒng)共同組成，WinRHIZO根系分析系統(tǒng)專業(yè)版還可以進行根系顏色分析：根的長度、面積、體積、根尖計數(shù)、根系存活數(shù)量等研究；根系連接分析：用于根系分支角度、連通性等形態(tài)研究；根系拓撲分析：連接數(shù)量、路徑長度等研究（需要根系完整）；根系分級伸展分析：記錄根系整體等級分布情況（需要根系完整）等。