實驗室在工作過程中可能造成實驗室環境的污染，如離心、混勻、接種、制片、移液、加樣等可產生氣溶膠污染，標本噴濺等可直接污染皮膚黏膜及實驗臺面和地面等。另外，由于室內環境空間的限制，設備、人員擁擠以及通風換氣不充分等都可能使實驗室內病原體的濃度增加，使人群在室內被污染的機會明顯大于室外。另 外，嚙齒動物、昆蟲等也都可攜帶傳播微生物病原體，給實驗室工作人員健康帶來威脅。
收集、貯存廢液注意事項
1).廢液的濃度超過一定的濃度時，必須進行處理。但處理設施比較齊全時，往往把廢液的處理濃度限制放寬。
2).先將廢液分別處理，如果是貯存后一并處理時，雖然其處理方法將有所不同，但將可以統一處理的各種化合物收集后進行處理。
3).處理含有絡離子、螯合物之類的廢液時，如果有干擾成份存在，要把含有這些成份的廢液另外收集。
4).下面所列的廢液不能互相混合：①過氧化物與有機物；②硫化物、次氯酸鹽與酸；③鹽酸等揮發性酸與不揮發性酸；④濃硫酸、磺酸、羥基酸、聚磷酸等酸類與其它的酸；⑤銨鹽、揮發性胺與堿。
5).要選擇沒有破損及不會被廢液腐蝕的容器進行收集。將所收集的廢液的成份及含量，貼上明顯的標簽，并置于的地點保存。特別是毒性大的廢液，尤要十分注意。
6).對硫醇、胺等會發出臭味的廢液和會發生氰、等有毒廢液，以及易燃性大的二硫化碳、乙醚之類廢液，要把它加以適當的處理，防止泄漏，并應盡快進行處理。
7).含有過氧化物之類爆炸性物質的廢液，要謹慎地操作，并應盡快處理。
8).含有放射性物質的廢棄物，用另外的方法收集，并必須嚴格按照有關的規定，嚴防泄漏，謹慎地進行處理。②雖然是有機類廢液，但也含有列于無機類廢液的物質，如果無機物質的濃度超過列于無機類該項濃度時，該廢液應另行收集。③有機類廢液的濃度系指含水廢液的濃度。
處理時一般應注意的事項
實驗室污染物的一般處理原則為：分類收集、存放，分別集中處理。一般廢棄物如廢紙等，應每日及時清理。實驗室要明確專人負責廢棄物的登記、收集和處理。實驗室廢液應根據其化學特性選擇合適的容器和存放地點，通過密閉容器存放(不能裝太滿，3/4即可)，不可混合貯存，標明廢液種類，貯存時間，定期處理。
1).隨著廢液的組成不同，在處理過程中，往往伴隨著產生有毒以及發熱、爆炸等危險。因此，處理前必須充分了解廢液的性質，然后分別加入少量所需添加的藥品。同時，必須邊注意觀察邊進行操作。
2).含有絡離子、螯合物之類物質的廢液，只加入一種消除藥品有時不能把它處理*。因此，要采取適當的措施，注意防止一部份還未處理的有害物質直接排放出去。
3).對于為了分解氰基而加入次氯酸鈉，以致產生游離氯，以及由于用硫化物沉淀法處理廢液而生成水溶性的硫化物等情況，其處理后的廢水往往有害。因此，必須把它們加以再處理。
4).沾附有有害物質的濾紙、包藥紙、棉紙、廢活性炭及塑料容器等東西，不要丟入垃圾箱內。要分類收集，加以焚燒或其它適當的處理，然后保管好殘渣。
5).處理廢液時，為了節約處理所用的藥品，可將廢鉻酸混合液用于分解有機物，以及將廢酸、廢堿互相中和。要積極考慮廢液的利用。
6).盡量利用無害或易于處理的代用品(參照附錄表6)，代替鉻酸混合液之類會排出有害廢液的藥品。
7).對甲醇、乙醇、丙酮及苯之類用量較大的溶劑，原則上要把它回收利用，而將其殘渣加以處理。
實驗室廢水處理的原理是將高濃度的廢酸堿液經中和后排放至中性。高濃度有機溶劑中含有少量被測物質和其他試劑應回收利用。用于回收的高濃度廢水應集中存放回收，低濃度廢水處理后排放，根據廢水性質確定貯存容器和貯存條件。不同的廢水一般不允許混合，避免光照，遠離熱源，以避免不良的化學反應。廢水儲存容器必須貼上標簽，注明類型、儲存時間等。
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