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上海酶聯(lián)生物研究所
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上海酶聯(lián)生物研究所
閱讀：271發(fā)布時(shí)間：2012-7-11
25年前，當(dāng)人類基因組計(jì)劃剛啟動(dòng)時(shí)，人們認(rèn)為這項(xiàng)解讀“人體構(gòu)成說明書”的工程，要數(shù)百臺(tái)測(cè)序儀、耗資30億美元和15年的時(shí)間才能完成。2003年，*套人類基因組序列的測(cè)序工作順利完成，但這項(xiàng)重大科學(xué)成果還只是一套粗略的草圖，其中還有巨大的空白需要*。
時(shí)間飛逝，2012年1月，美國(guó)拉斯韋加斯消費(fèi)電子產(chǎn)品展，在琳瑯滿目的和平板電視之中，zui吸引人眼球的是一款基因測(cè)序儀Ion Proton，這臺(tái)白色的電器跟打印機(jī)大小相仿。它的稱，這款測(cè)序儀將于今年推向市場(chǎng)，它能在幾小時(shí)之內(nèi)，以1 000美元的價(jià)格完成一個(gè)人的全基因組測(cè)序，而1 000美元只相當(dāng)于一臺(tái)不錯(cuò)的等離子電視的價(jià)格。
人們一直都把1 000美元的基因測(cè)序作為一個(gè)轉(zhuǎn)折點(diǎn)，認(rèn)為它預(yù)示著個(gè)性化醫(yī)療時(shí)代的來臨。基因測(cè)序的成本降到了這樣的程度，醫(yī)生就可以根據(jù)患者*的遺傳特征和藥物敏感性來治療心臟病、癌癥和其他疾病。隨著這樣的基因測(cè)序儀走向市場(chǎng)，行業(yè)觀察家們預(yù)測(cè)，對(duì)普通人進(jìn)行綜合遺傳檢測(cè)的時(shí)代已經(jīng)來臨。
但是，也有一些人認(rèn)為，這項(xiàng)技術(shù)還不成熟，不適合廣泛應(yīng)用。美國(guó)約翰斯·霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的遺傳學(xué)教授阿拉文達(dá)·查克拉瓦提（Aravinda Chakravarti）擔(dān)心，個(gè)體化基因組醫(yī)學(xué)的好處被夸大了。而且，人們沒有意識(shí)到，目前不論是通過醫(yī)生，還是在網(wǎng)上購買的全基因組測(cè)序結(jié)果都沒有實(shí)際的醫(yī)學(xué)價(jià)值。
主要問題是，這項(xiàng)技術(shù)發(fā)展得太快，研究人員對(duì)測(cè)序結(jié)果的解讀能力沒有跟上。例如，每個(gè)人的基因測(cè)序結(jié)果都必須與大量的其他人的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比較，這樣醫(yī)生才能知道哪些是重要的疾病指標(biāo)，哪些則可以忽視。另外，許多疾病是由一些罕見突變?cè)斐傻?，而科學(xué)家還沒有鑒別出這些突變。zui后，即使只是對(duì)一次基因組測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行簡(jiǎn)單分析，也是一件讓人頭疼的事情。美國(guó)斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的心臟病學(xué)副教授歐安·A·阿什利（Euan A. Ashley）說：“現(xiàn)在，基因測(cè)序已經(jīng)是既快速又便宜。但是，分析數(shù)據(jù)卻讓人頭疼，既不快速，也不便宜。”
為了說明這個(gè)過程會(huì)有多么復(fù)雜，阿什利和斯坦福大學(xué)、哈佛大學(xué)的幾位研究人員分析了他們一位同事、生物工程學(xué)教授斯蒂芬·奎克（Stephen Quake）的基因組序列。即使奎克早已測(cè)出了自己的基因組序列，有了原始數(shù)據(jù)，幾位科學(xué)家也花費(fèi)了整整６個(gè)月時(shí)間來思考，這項(xiàng)工作應(yīng)該如何進(jìn)行。
在奎克的家族史中，有幾例心臟病患者。果然，研究小組發(fā)現(xiàn)，他擁有幾個(gè)基因突變，都與心臟病的發(fā)作風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。這次分析還有一些意外發(fā)現(xiàn)，比如研究人員發(fā)現(xiàn)，奎克患上一種名為血色素沉著癥（hemochromatosis）的遺傳性血液疾病的風(fēng)險(xiǎn)有所增高，但奎克的家族中，還沒有人得過這種病。目前還不能確定的是，這個(gè)意外發(fā)現(xiàn)確實(shí)是患病風(fēng)險(xiǎn)升高的反映，還是測(cè)序過程出了錯(cuò)。
盡管有這些問題，阿什利還是樂觀地認(rèn)為，把個(gè)體化的DNA測(cè)序結(jié)果應(yīng)用于臨床是可能的。他認(rèn)為總有一天，個(gè)人的基因組序列將成為電子病歷上的常規(guī)內(nèi)容。但到目前為止，受益于全基因測(cè)序的那一小部分病人，大多具有罕見而明顯的基因突變。這對(duì)于我們其他人有什么樣的意義呢？我們拭目以待。
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