流動相在使用前必須進行脫氣處理，以除去其中溶解的氣體（如O2），以防止在洗脫過程中當流動相由色譜柱流至檢測器時，因壓力降低而產(chǎn)生氣泡。若在低死體積檢測池中，存在氣泡會增加基線噪聲，嚴重時會造成分析靈敏度下降，而無法進行分析。
此外，溶解在流動相中的氧氣，會造成熒光猝滅，影響熒光檢測器的檢測，還會導致樣品中某些組分被氧化或會使柱中固定相發(fā)生降解而改變的分離柱能。
液相色譜儀常用的脫氣方法有如下幾種：
- 吹氦脫氣法
使用在液體中比空氣溶解度低的氦氣，在0.1MPa壓力下，以約60ml/min流速通入流動相10-15min以驅(qū)除溶解的氣體。此法適用于所有的溶劑，脫氣效果較好，但在國內(nèi)因氦氣價格較貴，本法使用較少。
- 加熱回流法
此法的脫氣效果較好。
- 抽真空脫氣法
此時可使用微型真空泵，降壓至0.05~0.07MPa即可除去溶解的氣體。顯然使用水泵連接抽濾瓶和G4微孔玻璃漏斗可一起完成過濾機械雜質(zhì)和脫氣的雙重任務。由于抽真空會引起混合溶劑組成的變化，故此法適用于單一溶劑體系脫氣。對多元溶劑體系，每種溶劑應預先脫氣后再進行混合，以保證混合后的比例不變。
- 超聲波脫氣法
將欲脫氣的流動相置于中，用超聲波振蕩10-15min。但此法的脫氣效果zui差。
- 在線真空脫氣法（on line degrasser）
以上幾種方法均為離線（off-line）脫氣操作，其會隨流動相存放時間的延長又會有空氣重新溶解到流動相中。現(xiàn)在使用的在線真空脫氣技術(shù)，把真空脫氣裝置串接到儲液系統(tǒng)中，并結(jié)合膜過濾器，實現(xiàn)了流動相在進入前的連續(xù)真空脫氣。此法的脫氣效果明顯優(yōu)于上述幾種方法，并適用于多元溶劑體系
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