免疫組化技術是當今廣泛應用的檢測組織切片內特定蛋白的實驗手段。利用圖像分析軟件來判讀切片圖像上蛋白表達程度是隨著軟件技術的發展逐步應用到免疫組化技術中的。
     組織上的蛋白表達程度，在圖片上表現為免疫染色的深淺及面積大小。用肉眼只能定性地進行判讀，zui多粗略地作一個主觀的分級評價。使用圖像分析軟件則可以對圖片染色的程度作一個定量的測量。這個測量結果與切片上的蛋白表達強度有理論上的線性相關性。所以能客觀定量地反映它。

在圖像分析的方法中，使用灰度來表示一個點的明暗程度，而圖片上一個點的明暗程度是與切片上免疫染色物的“光學密度（OD，Optical Density ）"決定的，再往下追蹤一步，就是與組織切片上這個點的蛋白表達程度決定的。這有點類似于分光光度計的情形，比色皿里液體樣品的吸光度與液體中吸光成分的濃度相關，符合朗伯-比爾定律。圖片上一個點的光密度則與該點上的蛋白表達程度正相關（近似為正比）。所以測量一個點的光密度值，就是在測量這個點上蛋白表達程度的一個相對的量值。

這并不是因為圖像分析軟件測量不了圖片的光密度，而是因為在熒光圖片的拍 攝過程中，*不能把切片的熒光強度正確地表現到圖片的光密度上。zui終的定量分析結果恐怕還不如鏡下目視的判斷結果準確。